A Universidade de Évora está dividida em 4 escolas superiores: Artes, Ciências e Tecnologia, Ciências Sociais e Enfermagem. Oferece atualmente 41 cursos de licenciatura e 120 pós-graduações. A I+D+i abrange várias áreas científicas através de uma rede de 14 Unidades de Investigação que estão submetidas a avaliação internacional, sob a coordenação do Instituto de Investigação e Estudos Avançados.
A Universidade criou ainda três cátedras em áreas de excelência: Biodiversidade, Energias Renováveis e Património, que são patrocinadas através de capital privado. Nos últimos anos a universidade tem vindo a desenvolver uma grande relação com a comunidade, uma interação que é possível graças à criação de redes de trabalho e de partilha de conhecimento, tal como a participação no Parque de Ciência e Tecnologia, bem como a criação de protocolos e contratos de serviços em parceria com empresas, universidades, associações e institutos. As principais áreas de I+D são: Agronomia e Biodiversidade; Geografia, Ambiente e Paisagística; Materiais e Ciências da Terra; Economia e Gestão; Informática e Interoperabilidade de Software; Ciências Sociais e Políticas, História, História de Arte, Ciência e Cultura; Matemática Aplicada; Educação; Linguística e Literatura; Atenção ao Idoso. Os atuais projetos de I+D são desenvolvidos através de parcerias nacionais e internacionais, financiados pelo FP7, FCT e investimento privado.